Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms