Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT74Q96LB3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245 ms