Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPGRIP1Q96KN7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms