Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A4AQ96JQ5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms