Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BICD1Q96G01 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms