Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx8Q8CFD4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx8Q8CFD4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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