Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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BC106179Q8C9L1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC106179Q8C9L1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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BC106179Q8C9L1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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BC106179Q8C9L1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BC106179Q8C9L1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BC106179Q8C9L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BC106179Q8C9L1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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BC106179Q8C9L1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC106179Q8C9L1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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