Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD1L3Q7Z443 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD1L3Q7Z443 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms