Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KRT28Q7Z3Y7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms