Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms