Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms