Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CilpQ66K08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CilpQ66K08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms