Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCF4Q15080 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms