Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPNMBQ14956 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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GPNMBQ14956 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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GPNMBQ14956 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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