Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTCH1Q13635 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTCH1Q13635 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
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