Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC16Q13042 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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