Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YGL039WYGL039W 1047 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 PPX1YHR201C 1194 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 RPC25YKL144C 639 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 ENV10YLR065C 546 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 CST9YLR394W 1449 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 PRM6YML047C 1059 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 ENA5YDR038C 3276 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 CWH41YGL027C 2502 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 MAK21YDR060W 3078 nt2.89□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 RGC1YPR115W 3252 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 TDA8YAL064C-A 381 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YLR076CYLR076C 423 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 APC9YLR102C 798 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 MER1YNL210W 813 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 VPS3YDR495C 3036 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 KRE2YDR483W 1329 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 FAA2YER015W 2235 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YBR259WYBR259W 2067 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 SMC2YFR031C 3513 nt2.88□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 CYR1YJL005W 6081 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 UBP8YMR223W 1416 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 PNC1YGL037C 651 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YHL044WYHL044W 708 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 ARC18YLR370C 537 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 DYN3YMR299C 939 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YNL203CYNL203C 612 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 RRG7YOR305W 729 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YBR287WYBR287W 1284 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YBR300CYBR300C 498 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 NUR1YDL089W 1455 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 STN1YDR082W 1485 nt2.87□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YDR061WYDR061W 1620 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 DIG2YDR480W 972 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 SLD5YDR489W 885 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YFR054CYFR054C 579 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YGR107WYGR107W 450 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 BTN2YGR142W 1233 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 MVB12YGR206W 306 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 RPS21BYJL136C 264 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 LSM8YJR022W 330 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 PIR1YKL164C 1026 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 MRPL38YKL170W 417 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YLR217WYLR217W 324 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YNL050CYNL050C 813 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 TPK2YPL203W 1143 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 RRP15YPR143W 753 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 SHG1YBR258C 429 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 CIK1YMR198W 1785 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 CHS3YBR023C 3498 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 TAO3YIL129C 7131 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 FRE8YLR047C 2061 nt2.86□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YLR278CYLR278C 4026 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 PAM1YDR251W 2493 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 BNR1YIL159W 4128 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 CPR5YDR304C 678 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 EMI1YDR512C 564 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 STE2YFL026W 1296 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 MRM2YGL136C 963 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YGR283CYGR283C 1026 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 SPO11YHL022C 1197 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YJL169WYJL169W 369 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YLR012CYLR012C 300 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YSF3YNL138W-A 258 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 GRE2YOL151W 1029 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 SME1YOR159C 285 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 SRP1YNL189W 1629 nt2.85□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 MDM1YML104C 3384 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 ROM1YGR070W 3468 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YER138CYER138C 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YER160CYER160C 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YJR027WYJR027W 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YML039WYML039W 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YML045WYML045W 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YMR050CYMR050C 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 SYO1YDL063C 1863 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 POL3YDL102W 3294 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 PPH3YDR075W 927 nt2.84□□□□□ -1.95
RUP1Q12242 RSM24YDR175C 960 nt2.84□□□□□ -1.95
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