Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 MRPL38YKL170W 417 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 LIP2YLR239C 987 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ADI1YMR009W 540 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ATX1YNL259C 222 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 MBA1YBR185C 837 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RSN1YMR266W 2862 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 SKO1YNL167C 1944 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YCR013CYCR013C 648 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RPL17AYKL180W 555 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YLL044WYLL044W 447 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YNL203CYNL203C 612 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 DUF1YOL087C 3351 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RAD2YGR258C 3096 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 EPL1YFL024C 2499 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 LST4YKL176C 2487 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ATP22YDR350C 2055 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 MIX14YDR031W 366 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YDR262WYDR262W 819 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RMT2YDR465C 1239 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YGL159WYGL159W 1113 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 QCR10YHR001W-A 234 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YLR257WYLR257W 966 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 PAI3YMR174C 207 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RPL16BYNL069C 597 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YOL107WYOL107W 1029 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YBR063CYBR063C 1215 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 TIM12YBR091C 330 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 SUS1YBR111W-A 291 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YCL002CYCL002C 792 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 DYN1YKR054C 12279 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 GPI13YLL031C 3054 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RPL11BYGR085C 525 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ARL3YPL051W 597 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RPL11AYPR102C 525 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ADF1YCL058W-A 342 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ROM1YGR070W 3468 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RIX1YHR197W 2292 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 AVT2YEL064C 1443 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 VAS1YGR094W 3315 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 DYN2YDR424C 279 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 SAE2YGL175C 1038 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 MTC3YGL226W 372 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 PCL5YHR071W 690 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YKL091CYKL091C 933 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 CSI2YOL007C 1026 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 snR189snR189 189 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 CUR1YPR158W 759 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 FKH2YNL068C 2589 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YHR080CYHR080C 4038 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 MED1YPR070W 1701 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 CSR2YPR030W 3366 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YKL100CYKL100C 1764 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 BSC1YDL037C 987 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 BMH2YDR099W 822 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 SDS22YKL193C 1017 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 MST28YAR033W 705 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 VMA6YLR447C 1038 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RFC3YNL290W 1023 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 NTC20YBR188C 423 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ESC2YDR363W 1371 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YLR108CYLR108C 1458 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 PRP8YHR165C 7242 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YCL019WYCL019W 5313 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YDR133CYDR133C 336 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YPR1YDR368W 939 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 RNR2YJL026W 1200 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YJL147CYJL147C 1149 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ECM4YKR076W 1113 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 ECI1YLR284C 843 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 SEC66YBR171W 621 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 REC8YPR007C 2043 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 SRB4YER022W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM3Q12241 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.84□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.84□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.84□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YCL020WYCL020W 1317 nt2.84□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 JJJ2YJL162C 1752 nt2.84□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 ASI3YNL008C 2031 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 STI1YOR027W 1770 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YDR042CYDR042C 603 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 NTF2YER009W 378 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 MIC19YFR011C 513 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YIP1YGR172C 747 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YET1YKL065C 621 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 MCR1YKL150W 909 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 RPL22AYLR061W 366 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YLR230WYLR230W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YNL013CYNL013C 378 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YNL043CYNL043C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 RPL23AYBL087C 414 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 SRL4YPL033C 846 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YCL007CYCL007C 393 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM3Q12241 YMR317WYMR317W 3423 nt2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms