Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 HLR1YDR528W 1272 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 YMR187CYMR187C 1296 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 DAD3YBR233W-A 285 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 RPN4YDL020C 1596 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 DBF20YPR111W 1695 nt2.56□□□□□ -2
RUD3Q12234 PET191YJR034W 327 nt2.55□□□□□ -2
RUD3Q12234 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.55□□□□□ -2
RUD3Q12234 PRE8YML092C 753 nt2.55□□□□□ -2
RUD3Q12234 ARF3YOR094W 552 nt2.55□□□□□ -2
RUD3Q12234 MCT1YOR221C 1083 nt2.55□□□□□ -2
RUD3Q12234 GPI2YPL076W 843 nt2.55□□□□□ -2
RUD3Q12234 MUM2YBR057C 1101 nt2.55□□□□□ -2
RUD3Q12234 FMN1YDR236C 657 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 YDR290WYDR290W 330 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 DDI2YFL061W 678 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 ERG25YGR060W 930 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 COG2YGR120C 789 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 PCL7YIL050W 858 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 RNR2YJL026W 1200 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 BET5YML077W 480 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 YNL046WYNL046W 519 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 HRT1YOL133W 366 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 DNA2YHR164C 4569 nt2.54□□□□□ -2
RUD3Q12234 PET100YDR079W 336 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 TIM9YEL020W-A 264 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 NOP19YGR251W 591 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 LIP2YLR239C 987 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 FPR1YNL135C 345 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 YOR050CYOR050C 348 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 GRX1YCL035C 333 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 SPB1YCL054W 2526 nt2.53□□□□□ -2
RUD3Q12234 YDR186CYDR186C 2634 nt2.53□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YOL098CYOL098C 3114 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 SRT1YMR101C 1032 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 VMA9YCL005W-A 222 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 FKS3YMR306W 5358 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 RSE1YML049C 4086 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 SCY1YGL083W 2415 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 PTP3YER075C 2787 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YLR108CYLR108C 1458 nt2.52□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 SEC16YPL085W 6588 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 TFB1YDR311W 1929 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YCR064CYCR064C 411 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YGR050CYGR050C 357 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 PEX17YNL214W 600 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YNL276CYNL276C 396 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 RPB8YOR224C 441 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 ALG14YBR070C 714 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 CTP1YBR291C 900 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 PDR11YIL013C 4236 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 DNF1YER166W 4716 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 VAC8YEL013W 1737 nt2.51□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YGL218WYGL218W 651 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 ADH4YGL256W 1149 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 FIP1YJR093C 984 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 AIM36YMR157C 768 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YOL166CYOL166C 339 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YOR283WYOR283W 693 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 ISU1YPL135W 498 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YPL276WYPL276W 438 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 NEW1YPL226W 3591 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 BIT61YJL058C 1632 nt2.5□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YDL186WYDL186W 834 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 ROY1YMR258C 1662 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 MUB1YMR100W 1863 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YDR061WYDR061W 1620 nt2.49□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 TPS2YDR074W 2691 nt2.48□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 AFI1YOR129C 2682 nt2.48□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 SCD5YOR329C 2619 nt2.48□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.48□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 POP8YBL018C 402 nt2.48□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 TSR4YOL022C 1227 nt2.48□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 KSP1YHR082C 3090 nt2.48□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YNL018CYNL018C 1839 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 SDC25YLL016W 3147 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 TRM2YKR056W 1920 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 DSE2YHR143W 978 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 PEX18YHR160C 852 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 AIM32YML050W 936 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 BTS1YPL069C 1008 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 ATG5YPL149W 885 nt2.47□□□□□ -2.01
RUD3Q12234 MBA1YBR185C 837 nt2.47□□□□□ -2.01
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