Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN1BQ07699 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN1BQ07699 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms