Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FMODQ06828 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FMODQ06828 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FMODQ06828 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FMODQ06828 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms