Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR3Q03167 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms