Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms