Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SMARCA2P51531 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms