Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RORCP51449 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RORCP51449 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RORCP51449 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RORCP51449 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RORCP51449 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RORCP51449 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RORCP51449 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms