Protein–RNA interactions for Protein: P35998

PSMC2, 26S proteasome regulatory subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC2P35998 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC2P35998 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms