Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B1P20020 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms