Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOP1P11387 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1P11387 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1P11387 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1P11387 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1P11387 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1P11387 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1P11387 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1P11387 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1P11387 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms