Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB1P08034 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB1P08034 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB1P08034 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB1P08034 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB1P08034 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB1P08034 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB1P08034 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB1P08034 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB1P08034 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB1P08034 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB1P08034 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms