Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASS1P00966 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASS1P00966 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASS1P00966 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASS1P00966 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASS1P00966 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASS1P00966 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASS1P00966 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASS1P00966 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASS1P00966 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASS1P00966 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASS1P00966 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASS1P00966 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASS1P00966 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASS1P00966 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASS1P00966 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASS1P00966 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASS1P00966 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms