Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM2O94769 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM2O94769 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM2O94769 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM2O94769 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM2O94769 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM2O94769 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM2O94769 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM2O94769 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms