Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL5O76039 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms