Protein–RNA interactions for Protein: O15427

SLC16A3, Monocarboxylate transporter 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3O15427 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC16A3O15427 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A3O15427 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms