Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
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