Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
J3KT08 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
J3KT08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
J3KT08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
J3KT08 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
J3KT08 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
J3KT08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms