Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SERINC4A6NH21 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms