Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRCP1A6NGW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms