Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap99A0A140LIX9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap99A0A140LIX9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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