Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD1Q9UP38 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms