Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACL1Q9UJ83 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms