Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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