Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLKQ9UBT6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms