Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCHIP1Q9P0W5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCHIP1Q9P0W5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms