Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms