Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms