Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1LQ9HCJ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1LQ9HCJ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms