Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRDL1Q9BU40 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRDL1Q9BU40 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRDL1Q9BU40 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRDL1Q9BU40 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms