Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C16orf70Q9BSU1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms