Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAGED4Q96JG8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAGED4Q96JG8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms