Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms